《少年派的奇幻漂流》主要在印度与台湾进行拍摄。派的童年时期是在印度朋迪榭里拍摄的。制作团队进驻了城里一个占地20万平方英尺的摄影棚兼办公区。摄制工作在朋迪榭里市内和近郊共十八个地点出外景，光是电影一开始的几场戏，就动用了六百名工作人员，其中近半数为当地人；此外还出动了大约五千五百名当地居民担任临时演员。 应片中需求，城内的植物园被改造成虚构的朋迪榭里动物园。另外制作团队还获得许可，进入有千年历史的维瑞安努尔庙进行拍摄。除了有两千名临时演员熬夜参与拍摄，还有总数达两万盏的传统包叶烛灯彻夜点燃，而在场的所有工作人员则持续留意火烛。